Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8A2Q9NTI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8A2Q9NTI2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms