Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER2Q9NSB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms