Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BIN3Q9NQY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BIN3Q9NQY0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms