Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGB3Q9NQW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGB3Q9NQW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGB3Q9NQW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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