Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM8Q9NQV8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM8Q9NQV8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms