Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLDQ9NQC7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYLDQ9NQC7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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