Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC52A3Q9NQ40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC52A3Q9NQ40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms