Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4BQ9NPR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms