Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A4GALTQ9NPC4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A4GALTQ9NPC4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms