Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNB1IP1Q9NPC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNB1IP1Q9NPC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms