Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MID1IP1Q9NPA3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MID1IP1Q9NPA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID1IP1Q9NPA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms