Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPHS2Q9NP85 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPHS2Q9NP85 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms