Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ABCB9Q9NP78 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms