Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSU72Q9NP77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSU72Q9NP77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSU72Q9NP77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms