Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CENPJQ9HC77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPJQ9HC77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms