Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVMER34-1Q9H9K5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVMER34-1Q9H9K5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms