Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCQ9H7C4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCQ9H7C4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms