Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RETREG1Q9H6L5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG1Q9H6L5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms