Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC4Q9H6D8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC4Q9H6D8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms