Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIF1Q9H611 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PIF1Q9H611 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIF1Q9H611 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms