Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRDM12Q9H4Q4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM12Q9H4Q4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM12Q9H4Q4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms