Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD1Q9H3U5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD1Q9H3U5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms