Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX5Q9H2C1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX5Q9H2C1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms