Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP62CLQ9H1M0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP62CLQ9H1M0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP62CLQ9H1M0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms