Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K0

RBSN, Rabenosyn-5, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBSNQ9H1K0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBSNQ9H1K0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBSNQ9H1K0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RBSNQ9H1K0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBSNQ9H1K0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms