Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC22A4Q9H015 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms