Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTDSP1Q9GZU7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms