Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC90BQ9GZT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms