Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C20orf27Q9GZN8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C20orf27Q9GZN8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C20orf27Q9GZN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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