Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms