Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHLHE41Q9C0J9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms