Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR12Q9C0I1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR12Q9C0I1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms