Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTPBP4Q9BZE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTPBP4Q9BZE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms