Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms