Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RSPO3Q9BXY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms