Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FNDC11Q9BVV2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms