Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C9orf16Q9BUW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf16Q9BUW7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms