Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UPK3BQ9BT76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms