Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM29Q9BSF4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMM29Q9BSF4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM29Q9BSF4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms