Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UTP23Q9BRU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTP23Q9BRU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms