Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SEC22CQ9BRL7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC22CQ9BRL7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22CQ9BRL7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms