Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN3Q9BQT9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLSTN3Q9BQT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLSTN3Q9BQT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms