Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGME1Q9BQP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms