Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LPIN3Q9BQK8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms