Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKP2Q99959 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms