Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MEIS3Q99687 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MEIS3Q99687 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms