Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPS8Q99627 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPS8Q99627 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms