Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PSMD1Q99460 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMD1Q99460 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD1Q99460 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 458.6 ms