Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP2Q96SN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK5RAP2Q96SN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP2Q96SN8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms