Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC6Q96SB8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMC6Q96SB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC6Q96SB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms